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如何選定qPCR實驗用純水儀?

文章出處:網(wǎng)絡(luò) 人氣:發(fā)表時間:2022-08-24

目前疫情的防控工作取得了階段性的成效,基于實時熒光定量PCR的核酸檢測技術(shù)在新冠病毒快速鑒定及確診中發(fā)揮了重要作用。

什么是實時熒光定量PCR?

實時熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)技術(shù),簡稱qPCR,是在PCR反應(yīng)體系中加入熒光物質(zhì)(熒光染料或熒光標(biāo)記的特異性探針),利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程,最后通過標(biāo)準曲線對未知模板進行定量分析的方法。

與普通PCR相比,實時熒光定量PCR技術(shù)是一次由定性技術(shù)向定量技術(shù)的飛躍。運用該項技術(shù),可以對DNA、RNA樣品進行相對定量、絕對定量和定性分析。

實驗流程:

在實時熒光定量PCR實驗中,可以分為樣本采集,RNA提取,RNA質(zhì)量鑒定,反轉(zhuǎn)錄及數(shù)據(jù)分析幾個步驟,在進行引物、模板的稀釋,試劑的配制和補足反應(yīng)體系時都會用到水,水質(zhì)量的好壞直接影響最終數(shù)據(jù)分析的結(jié)果。

水中的顆粒物,離子含量,有機物及細菌微生物等雜質(zhì)對實驗都會帶來影響,最值得關(guān)注的因素有以下兩個方面:

1. DNA酶和RNA酶

DNA酶和RNA酶能夠特異性地降解DNA和RNA。在進行實時熒光定量PCR時,去除這兩種酶從而保證提取的RNA和DNA樣本的完整性十分關(guān)鍵。尤其在提取RNA的時候,RNA極易被降解。這是因為RNase非常穩(wěn)定,且無處不在,用常規(guī)的高溫高壓蒸汽方法和蛋白酶抑制劑不能使所有的RNase完全失活。如果樣本中的核酸被降解,會影響檢測結(jié)果的準確性,甚至造成假陰性檢測結(jié)果。

因此,實時熒光定量PCR實驗用超純水必須有效降低DNA酶和RNA酶的含量,減少對實驗的影響。

2. 鎂離子

實時熒光定量PCR實驗需要根據(jù)不同的引物對和模板確定最佳的鎂離子濃度。

Mg2+濃度過低,會影響DNA聚合酶的活性,導(dǎo)致產(chǎn)量降低,影響實時定量的敏感性;

Mg2+濃度過高,會增加引物二聚體的形成,這會影響特異性。

因此,實時熒光定量PCR實驗用超純水必須控制Mg2+濃度,避免背景因素帶來的不確定性。

綜上,實時熒光定量PCR實驗推薦使用超純水,水質(zhì)要求如下圖所示:

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